Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28bQ8CEG5 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28bQ8CEG5 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28bQ8CEG5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28bQ8CEG5 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28bQ8CEG5 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28bQ8CEG5 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28bQ8CEG5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28bQ8CEG5 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28bQ8CEG5 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28bQ8CEG5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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