Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp20Q8C6M1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp20Q8C6M1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp20Q8C6M1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp20Q8C6M1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp20Q8C6M1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp20Q8C6M1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp20Q8C6M1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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