Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1C8

Pnma1, Paraneoplastic antigen Ma1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma1Q8C1C8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms