Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms