Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ube3dQ8BX13 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ube3dQ8BX13 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ube3dQ8BX13 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ube3dQ8BX13 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ube3dQ8BX13 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ube3dQ8BX13 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ube3dQ8BX13 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ube3dQ8BX13 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ube3dQ8BX13 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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