Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp38Q8BW70 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp38Q8BW70 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp38Q8BW70 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp38Q8BW70 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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