Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8BP99 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BP99 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BP99 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BP99 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BP99 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BP99 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BP99 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BP99 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BP99 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BP99 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BP99 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BP99 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BP99 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BP99 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BP99 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BP99 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BP99 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BP99 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BP99 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BP99 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BP99 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BP99 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BP99 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BP99 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BP99 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BP99 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BP99 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BP99 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8BP99 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8BP99 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8BP99 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8BP99 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8BP99 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8BP99 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8BP99 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8BP99 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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