Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmem87bQ8BKU8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem87bQ8BKU8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms