Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms