Protein–RNA interactions for Protein: Q811S7

Ubp1, Upstream-binding protein 1, mousemouse

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1Q811S7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ubp1Q811S7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ubp1Q811S7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ubp1Q811S7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ubp1Q811S7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubp1Q811S7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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