Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms