Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrsam1Q80ZI6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms