Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc28Q80XJ3 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ttc28Q80XJ3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ttc28Q80XJ3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ttc28Q80XJ3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ttc28Q80XJ3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ttc28Q80XJ3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ttc28Q80XJ3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ttc28Q80XJ3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms