Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126 ms