Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms