Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc88cQ6VGS5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc88cQ6VGS5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc88cQ6VGS5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc88cQ6VGS5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc88cQ6VGS5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc88cQ6VGS5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc88cQ6VGS5 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc88cQ6VGS5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc88cQ6VGS5 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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