Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Krt39Q6IFX4 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Krt39Q6IFX4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Krt39Q6IFX4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Krt39Q6IFX4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Krt39Q6IFX4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Krt39Q6IFX4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt39Q6IFX4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Krt39Q6IFX4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Krt39Q6IFX4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Krt39Q6IFX4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Krt39Q6IFX4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Krt39Q6IFX4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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