Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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