Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rftn1Q6A0D4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Rftn1Q6A0D4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Rftn1Q6A0D4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Rftn1Q6A0D4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Rftn1Q6A0D4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Rftn1Q6A0D4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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Rftn1Q6A0D4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Rftn1Q6A0D4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms