Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Atg9aQ68FE2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Atg9aQ68FE2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Atg9aQ68FE2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Atg9aQ68FE2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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