Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms