Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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PtprdQ64487 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PtprdQ64487 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PtprdQ64487 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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PtprdQ64487 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PtprdQ64487 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PtprdQ64487 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms