Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc18Q640L5 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms