Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Defa17Q64016 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Defa17Q64016 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Defa17Q64016 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Defa17Q64016 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Defa17Q64016 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Defa17Q64016 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Defa17Q64016 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Defa17Q64016 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Defa17Q64016 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Defa17Q64016 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Defa17Q64016 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Defa17Q64016 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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