Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

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Length 993 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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