Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms