Protein–RNA interactions for Protein: Q61660

Foxj1, Forkhead box protein J1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj1Q61660 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxj1Q61660 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxj1Q61660 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxj1Q61660 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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