Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms