Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a1Q60714 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a1Q60714 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a1Q60714 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a1Q60714 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a1Q60714 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a1Q60714 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a1Q60714 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a1Q60714 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a1Q60714 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a1Q60714 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a1Q60714 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a1Q60714 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a1Q60714 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a1Q60714 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc27a1Q60714 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms