Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Med13Q5SWW4 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms