Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Psme4Q5SSW2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms