Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms