Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms