Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Trim58Q5NCC9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Trim58Q5NCC9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Trim58Q5NCC9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Trim58Q5NCC9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Trim58Q5NCC9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Trim58Q5NCC9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Trim58Q5NCC9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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