Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms