Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms