Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Usp48Q3V0C5 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Usp48Q3V0C5 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Usp48Q3V0C5 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Usp48Q3V0C5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Usp48Q3V0C5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Usp48Q3V0C5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp48Q3V0C5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp48Q3V0C5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp48Q3V0C5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp48Q3V0C5 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp48Q3V0C5 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp48Q3V0C5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp48Q3V0C5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp48Q3V0C5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Usp48Q3V0C5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Usp48Q3V0C5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Usp48Q3V0C5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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