Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tmed1Q3V009 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tmed1Q3V009 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms