Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
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D130052B06RikQ3UW13 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
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D130052B06RikQ3UW13 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
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D130052B06RikQ3UW13 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
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D130052B06RikQ3UW13 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
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D130052B06RikQ3UW13 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
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D130052B06RikQ3UW13 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
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