Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
D13Ertd608eQ3UPR8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms