Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gse1Q3U3C9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms