Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms