Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms