Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

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Length 1,733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Col24a1Q30D77 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Col24a1Q30D77 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Col24a1Q30D77 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Col24a1Q30D77 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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