Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms