Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms