Protein–RNA interactions for Protein: Q18PI6

Cd84, SLAM family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd84Q18PI6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd84Q18PI6 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms