Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam171bQ14CH0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms