Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ptcd3Q14C51 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms