Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rpusd2Q149F1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rpusd2Q149F1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms